Рейнгольд Иванович Рутц награждён юбилейной медалью им. Н. И. Вавилова, медалью «Ветеран труда», серебряной медалью ВДНХ, памятной медалью «Энциклопедия лучшие люди России», медалью им. И.И. Синягина «За особый вклад в развитие аграрной науки Сибири», удостоен почётных званий «Изобретатель СССР» и заслуженный ветеран СО Россельхозакадемии, Почётного знака «Руководитель научной школы».